根據菲律賓漁業局的初步報告，清晨5時20分，菲方漁業局巡邏艇MCS3007號，在巴丹群島（Batanes）的北島（North Island，台稱雅米島）離岸6.5浬處，也就是菲國領海範圍之內，發現昇豐12號，於是以「盜漁」嫌疑登臨及扣押。
漁業局局長培瑞斯（Asis Perez）表示，昇豐12號已於下午1時30分左右，被拖至巴丹群島省的省會巴斯戈鎮（Basco）留置，接受菲方進一步調查。
巴丹群島是菲國最北端的省分。
漁業局報告稱，登臨及扣押過程中，並未發生「不幸事件」（untoward incident）。
被扣押的漁民包括昇豐12號洪姓船長、黃姓輪機長，以及4名印尼籍漁工。洪姓船長向中華民國駐菲代表處表示，昇豐12號當時仍在尋找漁場，並沒有下延繩釣，應為無害通過。
但根據菲國漁業法，外籍漁船只要進入菲國海域，即視同非法捕魚，違者將被科處5萬到20萬美元的行政罰鍰，如果進入司法程序且罪名成立，還將加罰10萬美元，並沒收漁獲、捕魚器材及漁船。
由於通訊不良，菲律賓海岸防衛隊尚未與巴丹群島省人員取得聯繫，初步報告尚未出爐。