高鐵沿線地層下陷最新監測報告出爐，結果顯示彰化、雲林一帶有3路段地層下陷再擴大，雲林段最為嚴重，其中高鐵跨雲158縣道處下陷最嚴重，沉陷了4.6公分，較前年增加31％。由於今(2015)年又面臨68年大旱，有專家擔憂超抽地下水恐讓高鐵沉陷加速。對此，高鐵局回應，高鐵結構及行車安全無虞。而雲林縣政府也回應，將加強查緝違法抽取地下水部分，並禁止新挖水井。
因應超抽地下水造成彰雲地區高鐵沿線地層下陷，台灣高鐵公司自2003年起，每年定期對高鐵墩柱下陷進行監測。最新的2014年監測結果出爐，高鐵局表示，目前高鐵彰雲路段下陷較顯著的彰化溪州、雲林虎尾車站特定區、跨越雲158縣道及台78線快速道路等4處，除台78號快速道路處因路堤移除後地層回脹沉陷減少外，其餘3處下陷均略有增加，其中跨越雲158縣道近3年每年下陷量分別約4.0、3.5及4.6公分，但影響高鐵安全主要的差異沉陷墩柱的角變量為0.415/1500，仍在高鐵設計規範規定的容許值1/1500範圍內，目前高鐵結構及行車安全無虞。
為了澈底解決高鐵沿線地層下陷問題，行政院先後於2013年5月及12月核定實施「雲彰地區地層下陷具體解決方案暨行動計畫」(第一次修正)及「黃金廊道新方案暨行動計畫」，高鐵局強調，從減抽地下水增供地面水、地下水環境復育、加強管理、國土規劃等4大層面著手，將可減少地下水抽取，並有效處理彰雲地區地層下陷問題，對高鐵彰雲路段的結構及營運安全具有正面效益。高鐵局也承諾，將持續監督台灣高鐵公司監測高鐵橋墩下陷情形，並備妥具體應變方案，以確保高鐵營運安全。
高鐵沿線地層下陷被指最為嚴重地區是雲林縣，對此，雲林縣政府表示，探究其原因主要為高鐵基樁受負摩擦力影響，或者局部載重所造成基樁差異沉陷，而乾旱導致的地層下陷加劇為均勻沉陷，為其次要影響因素。
雲林縣政府指出，關於高鐵結構安全與行車安全部分，主要影響因素為高鐵基樁超沉導致基樁受負摩擦力影響，使得基樁承載力降低，或者局部載重所造成基樁差異沉陷使得基樁角變量過大，與本次乾旱地下水補注量不足導致的地層下陷加劇有所不同。
但對於超抽地下水部分，雲林縣政府說，因今年雲林地區降雨量不足，故對地下水補注較往年降低許多，使得地層下陷較往年更為嚴重，其中「針對違法抽取地下水部分，已配合水利署政策，加強查緝，並禁止新挖水井」，均依法裁罰。另外，查去年度部分地區配合休耕地活化政策，因大量轉作水田使得該區地下水抽取量大增，該區原已緩和的地層下陷再度趨於嚴重，目前已與農委會協調輔導休耕地活化改作旱作事宜。