雲林縣為加強地下水管理，於102年1月1日至102年12月31日受理20鄉鎮市水井納管申報作業，截至102年12月31日為止，納管水井件數為162,124件，縣府將於本年度開始，分三階段委由專人會同列案水井申請人辦理納管水井複查作業，實地確認水井使用狀態、規格後裝置辨識標籤，所有納管水井複查作業將於105年前完成。
第一階段納管水井複查確認工作已於104年1月開始辦理，辦理鄉鎮包含虎尾鎮、土庫鎮、二崙鄉、元長鄉、西螺鎮及北港鎮等，統計至4月20日為止，虎尾鎮已完成水井複查確認之水井數量為2,550口，土庫鎮已完成水井複查確認之水井數量為5,437口、二崙鄉已完成水井複查確認之水井數量為2,353口、元長鄉已完成水井複查確認之水井數量為4,103口、西螺鎮已完成水井複查確認之水井數量為7,330口、北港鎮已完成水井複查確認之水井數量為7,330口。