不過，後續仍可協商，全案還必須經過二、三讀程序才能完成修法。
台灣團結聯盟立法院黨團總召集人賴振昌認為，公投提案只要1人就可以提；民主進步黨籍立法委員鄭麗君版本則是從現行總統副總統選舉人總數千分之5以上降至萬分之1以上。
行政院秘書長簡太郎今天表示，將來可以用電子系統進行提案及連署，提案人數不能太低，不然公投審議委員會一天到晚要審查。從原本千分之5降到千分之3，「這樣的門檻比起外國已經低了」。
經過朝野協商，民進黨籍立委陳其邁提議千分之2；中國國民黨籍立委徐志榮建議折衷的千分之2.5，國民黨籍立委吳育昇也支持。
簡太郎表示，可以接受提案門檻千分之2.5，但連署門檻不能再降，投票門檻1/2（公投案投票人數達投票權人總數1/2以上，且有效投票數超過1/2）一定會堅守。他說，這是很嚴肅的問題，不是隨便喊價；如果把門檻無限制降低，只是讓人憂心。
民進黨籍立委對簡太郎說法不滿，陳其邁隨後主張以千分之1和千分之2.5進行表決，國民黨籍立委不願意表決，全數離席。
內政委員會輪值召委、民進黨籍立委姚文智決議，以民進黨籍立委潘孟安版本為準，通過將提案門檻改為萬分之1以上。
吳育昇受訪表示，民進黨一開始願意接受千分之2，和他主張的千分之2.5僅差0.5，應該可以協商，但民進黨卻用這種粗暴方式，應是受外圍團體壓力影響；且還要求國民黨籍立委先表態再來審查，侵犯立委審查權和尊嚴，因此離席抗議。
島國前進上午在立法院外聚集，訴求「補正公投法」，島國前進發起人陳為廷10時左右突然和10多人企圖闖入立院中興大樓一樓，與駐衛警發生衝突，中興大樓拉下鐵門。陳為廷隨後率眾繞行立法院，揚言要找國民黨籍立委張慶忠。
張慶忠則在駐衛警護衛下前往內政委員會開會，他表示對學生的舉動「習以為常」。1040422