玄奘大學社會科學院院長釋昭慧今（10）日在臉書po文指出，哈崙台基督長老會申請變更保護區為宗教專用區過關，她批評，「台北市政府在面對保護區時，竟然有兩套標準」？對此，台北市長柯文哲表示，「還是一套標準啦，本來就是消防局的，本來建築物、東西就在那裡，去改建而已」，他強調，做事只有一套標準，這不是問題。
柯文哲下午視察台北市抽水站自動化監控系統，接受媒體訪問時，作上述表示。
對此，北市都發局也發布新聞稿澄清說，有關北市府104年3月2日公告實施「變更台北市士林區福林段二小段387及387-4地號等2筆土地保護區為機關用地主要計畫案」之基地，位於台北市士林區中山北路五段376號，現況為一樓建築，緊鄰中山北路五段幹道，地勢平坦非屬山坡地。
都發局表示，該地點民國65年起，即供市府消防局第四救災救護大隊士林中隊及劍潭分隊使用，迄今已逾38年，由於該消防基地位於士林地區中心地帶，聯外交通動線完善，可迅速救災及有助支援鄰近勤務，為市府消防局於士林區之重要據點，惟因廳舍及設備急需進行改善，故將其由保護區變更為機關用地，以利市府消防局進行相關改建（善）工程，係符合都市計畫法第27條第1項第4款規定，並無濫用法令及破壞保護區之情事。
都發局進一步表示，本案係於都委會103年12月18日第667次大會報告通過「全市性保護區處理原則」時，即已通過北市都委會審議之案件，縱使要求公平比照「全市性保護區處理原則」檢討，本案亦符合前開原則「3.政府在保護區內為施作必要之公共設施，得檢討變更為公共設施用地，如有急迫性需要時，得依都市計畫法第27條辦理迅行變更。」，並無兩套標準之疑慮。
都發局指出，至於哈崙台基督長老教會「保護區變更為宗教專用區案」係位於「變更谷關風景特定區計畫（第三次通盤檢討）案」內，擬定機關為「台中市政府」，非屬「台北市政府」轄區範圍內計畫案。