台灣的糧食自給率只有3成，主要的食品都是仰賴進口。根據食藥署統計，全球193個國家當中，光是2013年就有162個國家的食品輸入台灣，當中以加工食品輸入的批數最多。
食藥署食品組技正白美娟指出，雖然台灣的食品來源國很多，但是主要還是集中在日本、美國、中國大陸、泰國跟越南。如果以批數來看，鄰近的日本是食品輸台的最大國。她說：『(原音)102年輸出到我們國內共有162個國家，這些國家來講的話，以批數來講，前五名是日本、第二名是美國，其次是中國大陸、泰國跟越南；以日本來講的話，可能日本我們跟他們比較鄰近，日本的加工產品比較多樣化，所以他的批數就會比較多。』
特別的是，台灣民眾對咖啡需求度高，目前市面上的咖啡來自全球73個國家，最為多元，當中又以日本、美國、越南、印尼、馬來西亞報驗批數最多；其次則是冷凍魚類產品，也來自全球71國。
如果以不合格的類別來看，日本輸台的食品中，生鮮冷凍水果最容易出現違規，中國大陸則是以「藥食兩用」的產品最多違規，像是人蔘、當歸等，主因都是農藥殘留。
近年來食品安全議題越來越受到關注，食品進口的分類也越來越細，食藥署指出，目前公告的食品號列高達2328項，業者一旦檢驗不合格邊境抽驗比率可從最低5%提升最高100%，檢驗量也因此隨之暴增。