教育部表示，「特殊教育學生獎補助辦法」中規定，持有縣（市）村、里長核發清寒證明的學子，由教育部依規定給予教育補助費，主食費每月700元，副食費每月2,300元。雖然國民所得逐年提高，教育部為鼓勵身心障礙學生適性就學，依舊秉持政府照顧弱勢族群之政策，放寬補助基準為家戶最近一年度所得未超過220萬元者，皆可獲得每月3,000元伙食費補助（按月補助，以十個月計算，七、八月不計）。
過去學生每週上課六天（平均每天115元），現今每週上課僅五天（平均每天136元），住宿型特教學校為了讓孩子們多點與家人相處的機會，週一早餐與週五晚餐為在家用餐（每週13餐，平均每餐58元）。不過教育部有感於民生物價水漲船高，特教生們的伙食在校方以及廚工們的努力之下，始終維持一定的品質。教育部為了讓就讀特殊教育學校的孩子們，獲得更完善更優質的伙食與團膳，於104年5月起調增補助為每名每月3,300元（平均每天150元）。另外，經特殊教育鑑定及就學輔導會安置於國立特殊教育學校之在家教育學生，也享有伙食費補助的資格。