總統府31日晚間原定舉行的抗旱國安高層會議，由於行政院長毛治國與閣員仍在立法院備詢，因此將另擇期舉行。毛治國則因受台聯上午杯葛議事影響，晚間8點左右才結束備詢。
總統府發言人陳以信昨晚表示，總統馬英九今天將召開國安高層會議，召集毛治國與相關部會首長，聽取抗旱與長期水資源政策因應等相關簡報。不過，受到行政院長及多數首長仍在立法院備詢，總統府晚間表示，今晚原訂7時舉行抗旱國安高層會議，將另擇期舉行。
立法院31由毛治國率領行政院國防外交與經濟相關領域官員接受立委總質詢，不過由於立法院上午因台聯抗議大陸強行通過M503海峽中線新航線與政府未經朝野共識逕行去函大陸國台辦表達加入亞投行意願，以占領主席台的方式杯葛議事，造成原訂上午開始的總質詢直至下午兩點半才正式開始。
而上午為了M503航線與馬政府逕行向國台辦表達加入亞投行意願，台聯立委與國民黨立委在台上拉扯，國民黨立委羅淑蕾甚至「擒抱」台聯立委周倪安。
台聯黨團一早就在議場主席台上擺放標語，包括「反對M503改變台海現狀」、「伸入亞投行，馬又搞黑箱」。台聯立委葉津鈴持續在發言台叫陣「賣台政府、不要做賣台賊、你們把台灣賣得差不多了」。
後來包括國民黨政策會執行長賴士葆、黨團書記長廖國棟、首席副書記長林德福、藍委吳育仁、李貴敏、江惠貞、王育敏、鄭汝芬、潘維剛等人，陸續上到主席台，以人海戰術強行護送副院長洪秀柱主持議事，雙方僵持不下，在叫罵聲中杯葛超過一個小時後才結束。
最後，立法院傍晚進行朝野協商，要求陸委會與民航單位將有關M503航線與大陸國台辦等單位的協商過程，以完整報告方式送立法院內政委員會。