慈濟最近引發不少爭議，還有釋昭慧的言語也引發不少風波，還被起底慈濟投資「邪惡基金」，慈濟雖然宣布撤除內湖保護區開發案，以及撤除疑慮的投資標的，還是沒有讓事情因而停止，話題仍持續延燒，輿論不斷。連投入慈濟義診及演講20年的醫師林耕新今(18)天也在臉書上寫下痛徹心扉的文字表示，暫時不到慈濟服務了，「換掉這群利益薰心的人後，我希望可以早日再到慈濟服務」。
高雄市耕心療癒診所醫師林耕新今天在臉書上PO文表示，「20年來，只要慈濟的召喚，我從不拒絕，也很樂意幫忙，每年做心理志工訓練、演講，頂著大熱天到環保回收站作義診」，當聽到對慈濟的指控時，「隨著陸續曝光(當然有不實指控)的訊息，我大多認為是名嘴或媒體的加油添醋，聽聽就好！」
但聽到慈濟投資「邪惡基金」一事，林耕新認為，「投資孟山都、波音公司(這家公司的大業務是做殺人武器)、菸商，慈濟高層說是美國分會『自己』的投資，善款跟台灣無關，而且會通盤檢討爾後投資，請問我生的小孩到美國就不是我的嗎？董氏基金會反菸，如果他們投資菸商，然後跟大家說我需要更多的錢反菸，你能接受嗎？」
林耕新還說，「拿善款投資股票就已經不對(因為慈濟不是營利公司)，還投資與基金會理念嚴重相左的上市公司，更可惡的是短線操作，孟山都是邪惡企業，專門從事基因改造，搞得植物生態大亂，與環保、有機的概念南轅北轍，強調和平的宗教團體，竟投資武器生產公司，這已經超出我的極限」。
雖然慈濟有這樣的投資，但林耕新認為，「證嚴法師沒有問題，廣大信眾更是無辜」。但他斥責，「有問題的是由商人、建設公司老闆、利用慈濟名號循私營利的管理階層，你們對得起幾十年來默默為慈濟付出的善男信女，你對得起你的良心嗎？」
也因為這樣，讓林耕新決定暫時不去慈濟服務，並要求慈濟，「換掉這群利益薰心的人後，我希望可以早日再到慈濟服務！最後，我想向在慈濟的好朋友說聲抱歉，得罪您們了！」此外，他還在下方留言表示，「慈濟應該立刻停止收捐款！」