對最近部分名嘴與民代質疑馬總統曾於民國97年3月17日，與前交通大學校長張俊彥密會，針對日後考試院長的提名權，與張俊彥密室交易。府方人士晚間嚴正駁斥，澄清當年絕無「密會」之事，相關說法都未經查證、道聽途說。
府方人士說，當天是總統大選投票前5天，馬總統在緊湊掃街行程中抽出半小時，由競選總部負責科技議題的幹部尹啟銘安排及薛香川等人陪同下，前往張俊彥位於新竹縣寶山鄉嵩翠路住所拜會請益，就台灣科技發展交換意見，全程有多人在場，馬總統根本未與張俊彥進行「密會」，更沒有所謂「密室交易」的存在。
府方人士表示，尤其在場人士中，根本沒有聯電前董事長宣明智，因此所謂「馬宣張三人密會」，根本就是無中生有的烏龍指控。