媒體報導指出，柯文哲為追討台北市政府當初為捷運新蘆線代墊的新台幣100億元，去年底已委託律師赴高等行政法院對交通部提告，要求還錢，且連新北市長朱立倫也一併提告，「如果交通部不還，就新北市還」。
柯文哲下午出席「公共住宅計畫首部曲—聯開宅釋出記者會」，會中媒體提問北市提告朱立倫一事，柯文哲表示，北市新市府團隊成立才兩個多月，有時只是在整理過去的帳。
他指出，興建捷運新莊蘆洲線，新北市政府要付、省政府要付、台北市政府也要付，但因統籌機構是台北市政府，所以由北市府先代墊，但後來精省後就找不到案主付新台幣100億元。
柯文哲表示，錢要怎麼在帳目上解決，就應該要去處理，今天只是提出一個問題「要怎麼解決過去的帳」，交通部若說他們要解釋，也是可以。
他說，事實上北市不是要告新北市政府，新北市政府正確解釋叫做「關係人」，這次主要目標是交通部。地方政府和中央政府若有爭議，應該要去處理，會儘速跟交通部協商，看這筆錢如何在帳面上解決。
媒體追問為何不先和交通部協商後再提告？柯文哲表示，因為台北市議會有決議此事一定要處理，加上審計部糾正，其實這個問題不是今天才有，是好多年前的帳，「只是我們做為比較勤勞的政府」，不會擺著不理它，既然有爭議就趕快處理。
柯文哲說，「親兄弟明算帳」，該做的就要做，不可以一個帳擺在那邊好幾年。