大學評鑑受到各界批評，在教育部主導下，逐步由「外評」改為「自評」，也就是由學校自己訂機制、自己評鑑，再由公正單位認可，回歸協助學校審視自我發展的理念。
103年度科技校院自評，共有9所學校獲得認定，包括雲林科大、屏東科大、台北科大、高雄第一科大、朝陽科大、南臺科大、崑山科大、樹德科大、弘光科大。
104年度，根據評鑑雙月刊公布的訊息，共有8校符合「教育部試辦認定科技校院自我評鑑機制及結果審查作業原則」，將由台灣評鑑協會進行一天的實地訪評。
104年度參與自評的科技校院，包括南開科大、高雄海洋科大、台灣科大、正修科大、高雄應用科大、虎尾科大、龍華科大、慈濟技術學院。
根據教育部規定，只有曾獲得典範科技大學計畫、教學卓越計畫、或是最近一次綜合評鑑行政類成績一等的學校，才能自我評鑑。