針對中國大陸片面劃設M503等新航路的問題，陸委會發言人吳美紅26日在例行記者會上重申，陸方應理解台灣民意，尊重台灣民眾的感受，並考量兩岸和平穩定的大局；外界關切我方政府的因應作為，吳美紅僅強調，政府會做好各種準備，她說：『(原音)真的因為還在溝通當中，所以我只能說政府會做好各種因應準備。』
另一方面，外交部國際組織司司長周台竹則指出，外交部已透過管道促請國際民航組織出面協助，他說：『(原音)中國大陸跟我們還沒有完成協商之前，我們也透過我們的管道向ICAO表示，希望它也能夠敦促中國大陸跟相關受影響的國家做一個商議，這一定要雙方、大家有個共識之後才實施，對飛航安全是比較好的。』
相關人士說，新航路的議題兩岸仍在進行溝通，但政府準備的因應作為，外界「不用低估我們的能力」。
至於兩岸兩會舉行第11次高層會談的進度是否受到M503議題的影響，吳美紅回應表示，這得視避免雙重課稅、飛航安全與適航標準、環保合作等6項協議的協商情況而定，但目前這些協議都還在進行協商。