林祖嘉出席海峽交流基金會舉辦的「2015大陸台商春節聯誼活動」致詞表示，過去1年，陸委會實現兩岸事務首長互訪制度化，創造兩岸官方正常互動開端，達成兩岸分治65年來歷史性的里程碑。
但他說，考量到2月初復興航空發生空難，台灣關切大陸片面劃設M503等4條新航路的議題溝通尚未完成，經雙方充分商議，決定暫緩大陸國務院台灣事務辦公室主任張志軍訪問金門。
林祖嘉表示：「我們認為，復興空難與航路議題都涉及飛航安全。政府也呼籲大陸方面，應該考量台灣民意重視此一議題的反應、尊重台灣人民的感受，務實與我方進行溝通。」
林祖嘉提及陸委會未來工作重點時指出，新的一年將雙軌推進兩岸經貿合作與台灣參與區域經濟整合。
他說，台灣曾是「亞洲四小龍」，如今面臨其他新興經濟體挑戰，參與國際經濟整合對台灣而言是重大生存議題，不僅有助台灣經濟和亞太乃至全球市場連結，也會大幅增強民眾對兩岸貿易自由化的信心。
林祖嘉呼籲，大陸必須深刻體會台灣民眾長期渴望加入區域經濟整合的心聲，兩岸經濟合作和兩岸共同參與區域經濟整合兩者應雙軌並行，「沒有誰先誰後的問題」。
他強調，台灣不能被世界經濟發展排除在外，也不能以兩岸經貿合作優先，而阻擋台灣參與區域經濟的權利；陸方對此若能有具體的正面回應，相信能獲得台灣社會好感，讓兩岸關係繼續朝良性互動方向邁進。