對於王金平黨籍案，馬英九總統強調此案涉及國民黨的核心價值，必須加以釐清，否則會影響國民黨的長遠運作。
國民黨主席朱立倫對此表示，無論是社會各界或法院，對於國民黨過去的考紀制度都有不同的意見和批評，國民黨也接受指教，所以現在的考紀委員都經過黨內的民主基礎所產生，因此未來的懲戒、處分的制度，都會按照公開、程序正義的方式處理，相信所有問題將來都能迎刃而解。朱立倫：『(原音)我們現在一切都回歸制度，一切都按照新的考紀委員，新的處分規程來處理，所以不管任何有爭議性案件，或者社會關心的所有黨紀案，我們都會按照這樣的制度，透過這樣的制度，符合程序正義，也符合大是大非來處理。』
朱立倫強調，王金平黨籍案也將按照相關制度進行。