據行政院大陸委員會官網，王郁琦聲明全文如下：
今日台北地方法院檢察署針對張顯耀前副主委涉嫌洩密一案，作出不起訴決定，本人必須坦誠的說，我無法認同這樣的結果，並且感到非常失望與無奈。過去這段時間，陸委會已經盡可能提供資料給檢方，能做的、該做的，陸委會都做了，但是辦案過程中所需要的其他佐證，以及法律責任的認定，已經不是陸委會的權責。就算我無法認同檢方決定，但基於對司法的尊重，我也只能接受這項結果。
從檢方的不起訴理由中，顯示張顯耀的確涉及在與陸方談判前洩漏談判內容、將機密資料透過一名台商轉交陸方，以及透過國內一家企業所供養的民間助理，處理涉及國安的政府機密資訊等行為。針對檢方認定此一涉及國安的案件未達違法程度，變成一種「不起訴的洩密」，本人非常遺憾，雖然無法認同檢方決定及理由，但因本案處理過程引發社會紛擾，本人願負起政治責任，請辭陸委會主委一職。
今日檢方雖對張顯耀案作出不起訴處分，然而相關證據也顯示他曾有不當的洩密行為。張顯耀的所作所為，或許迴避了法律的責任，但他身為一個政務官，尤其位居兩岸事務中這麼重要的一個位置，已經逾越了應有的本分。
本人在發現張顯耀出現可能影響國家安全的工作疑點時，主張必須先將其調離現職接受調查，但同時希望在相關事證尚未由檢方釐清之前，能依無罪推定之原則，兼顧他的名譽與權益。案發後，媒體與立委均曾對本人是否應於本案調查結果出爐後，辭職下台作出評論與質詢，然而我在當初向長官報告本案時，即已表示願意負該負的責任。因此今日辭職負責的結果，本人無怨無悔。為了維護國家安全與談判團隊的紀律，就算時間重來，就算知道自己最後必須離開這個位子，我還是會做出一樣的選擇。
陸委會的工作，必須承受來自各方壓力，並常遭外界誤解與責難。然而本人在陸委會同仁襄助之下，堅持捍衛台灣的安全與利益，並於任內建立兩岸事務首長互訪，以及陸委會與國台辦間常態性溝通聯繫機制，對兩岸互動將產生深遠的影響。對於有機會能夠從事公職，為培育自己的台灣社會作出貢獻，本人感到十分榮幸，也感謝各位媒體朋友對我的鞭策與指教。農曆新年將至，謝謝大家，也祝福各位。