王郁琦還說，張顯耀透過國內一家企業所供養的民間助理，處理涉及國家安全的政府機密資訊。對於檢方認定，如此涉及國安的案件未達違法程度，變成一種「不起訴的洩密」，感到非常遺憾。
台北地方法院檢察署10日偵結行政院大陸委員會前副主委張顯耀被控洩密案，因犯罪嫌疑不足，予以張顯耀等3人不起訴處分。王郁琦中午召開記者會，宣布請辭陸委會主委一職。
王郁琦指出，檢方不起訴理由顯示，張顯耀的確涉及在與陸方談判前洩漏談判內容，將機密資料透過一名台商轉交陸方，以及透過國內一家企業所供養的民間助理，處理涉及國安的政府機密資訊等行為。
他說，相關證據也顯示，張顯耀曾有不當洩密行為。「張顯耀所作所為，或許迴避了法律責任，但他身為一名政務官，尤其位居兩岸事務中這麼重要的位置，已經踰越了應有的本分。」
王郁琦表示，對檢方認定本案未達違法程度，變成一種「不起訴的洩密」，感到非常遺憾。雖然無法認同檢方決定及理由，但因本案處理過程引發社會紛擾，願負起政治責任，請辭陸委會主委一職。
他說：「今日辭職負責的結果，本人無怨無悔。為了維護國家安全與談判團隊紀律，就算時間重來，就算知道自己最後必須要離開這個位置，我還是會作出一樣的選擇。」
他提到，陸委會過去這段時間已盡可能提供資料給檢方，辦案過程中所需要的其他佐證以及法律責任認定，已非陸委會權責。「就算我無法認同檢方決定，但基於對司法的尊重，我也只能接受這樣的結果。」