行政院長毛治國今（5）日在行政院會前率閣員為復興航空空難罹難者默哀，表達最深的哀悼之意。會中毛揆聽取交通部「復興航空公司GE235空難事件處理情形」報告後，指示相關單位加強搜救尚未尋獲的旅客；針對罹難及受傷乘客，亦請交通部確實督促復興航空協助處理後續事宜，並主動協助罹難者家屬理賠等事宜。
行政院表示，毛治國感謝台北市、新北市的消防單位、國軍及民間單位於第一時間全力搶救。毛治國也在今日凌晨12點半，致電給救災現場的台北及新北市兩位消防局長，提醒救災人員注意自身安全及保暖。
針對飛安部分，毛治國指示民航局即刻要求復興航空全面加強飛安相關作為，並督導其他航空公司加強飛安自我督察，以強化飛安。
此外，毛治國說，飛航安全調查委員會將依相關規定進行事故調查工作，請加速辦理相關作業，針對航機操作、飛機維修等，查明事故可能原因，適時對外說明。