47歲的後藤疑似遭伊斯蘭國殺害的影片在網路流傳。後藤高齡78歲的母親石堂順子聞訊後聲明表示，「現在驚嚇到不知該說什麼話，我兒子是為了救日本同胞而到敘利亞的，請大家了解我兒子的善良與勇氣。」
後藤的胞兄、55歲的後藤純一對日本放送協會（NHK）表示，「感謝日本政府、日本全國、世界上許多人的支援，身為哥哥的我一直希望健二平安歸來，然後向大家道謝。結果真的令人非常遺憾。」
後藤去年10月25日離開家，前往中東，出發前告訴妻子說，要去救日本人質湯川遙菜。後藤離開日本時，後藤妻子所生的次女才3週大。
去年12月2日，後藤的妻子收到來自「伊斯蘭國」的信，得知丈夫後藤出事了。今年1月20日，後藤的妻子收到「伊斯蘭國」傳到她的電子郵件信箱的1支影片，內容疑似伊斯蘭國的蒙面黑衣男說，要求日本在72小時內支付2億美元贖金，「否則刀子將成日本人的惡夢」。之後，伊斯蘭國多次傳來電子郵件交涉。