針對西門町雙屍命案偵破，台北市長柯文哲建議監聽改成「登記制」，引發爭議，柯文哲今（26）日受訪時表示，人民的隱私權、人權是一定要保護，但是在效率跟人權之間，如何取得一個平衡，應該有個通權。像這個案子是很明顯的，已經知道犯人是誰，要去追還要等48小時調通聯記錄，就怪怪的，他強調，不要作個案處理，已經責成警察局長邱豐光去跟法務部商討，看要不要寫規則。
柯文哲昨表示，由於馬王9月政爭關係，現在調通聯記錄要花2天，申請監聽時也要先跟檢察官申請，再經過法官核准，整個時程就拖掉了，希望市警局跟法務部協商，未來可採「先斬後奏」登記制。
柯文哲今指出，這個問題這幾天引起很大的討論，他還特別去讀法令，監聽如果是司法機關，得要由檢察官同意，檢察官簽核要4小時，必要延長要4小時，就要八小時，再送法官同意，法官48小時內要回覆，加一加就要56小時。
柯文哲說，過去他當外科醫生，動手術要有家屬同意書，以前在加護病房，常常也沒有家屬同意就動刀 ，因為病患就是在流血，血壓掉了，不可能把家屬從家裡叫來醫院，簽同意書再動刀，有時甚至沒有送進開刀房，直接在加護病房就鋸胸開刀，「我們常常幹這種事」。
柯文哲還透露，台大加護病房在沒有家屬同意的情況下動刀，一年快200多次，如果都要等到家屬同意才動刀，很多病患在加護病房就死了，很多出血根本來不及。
柯文哲強調，他不認為所有案件都要先斬後奏，或是先登記，但像這種很明確，已經知道對象要抓他，還要等48小時才能調通聯記錄，一聽就知道不合理，應該在原有法律制度之下，把例外的情形要怎麼作，要列出來，他表示，幸好犯人沒有逃出去，如果是這48小時就溜走、出境，就抓不回來了。
至於民進黨立委段宜康諷刺柯文哲與前檢察總長黃世銘「相見恨晚」，柯文哲則說，還有人在這件事上提到蔣經國，他實在很受不了「標籤化」，貼個標籤。
柯文哲說，從選前到現在，這問題講過太多遍，講到蔣經國，有一批人就起乩，有些人提到陳水扁也起乩，這個國家就是這樣，他認為這案子可以坐下來討論，人權要保護，但是有些例外情形，是不是可以另外列出來。