禽流感疫情持續擴大，防檢局13日公布最新檢測結果，雲嘉地區再新增確診11場鵝場，總計已經有20場確診案例，預計影響27萬隻鴨鵝產量。疫情除了南臺灣高雄、台南也傳出疑似案例之外，更有持續向北延燒的跡象，包括彰化、桃園都出現異常死亡或產蛋率急速下降的狀況，估計全台總計7縣65場爆發異常死亡疫情，農委會主委陳保基表示，為控制疫情發展，只要驗出H5病毒就會進行撲殺。行政院副院長張善政也強調，將以「超前部署」的精神面對疫情處置。
據防檢局統計至今日11時止，今日再新增11確診鵝場，其中雲林縣新增7場、嘉義縣2場、屏東縣2場；農委會證實，此波禽流感為國內首次水禽最嚴重疫情，全台至今有20場確診案例，確診場中有14場為新型H5N2亞型禽流感，6場為H5N8亞型禽流感。而前通報禽流感疫情的場次更從昨天的38場增加到今天的65場，防檢局指出，包括桃園市、彰化縣、雲林縣、嘉義縣、台南市、高雄市、屏東縣等7縣市都正送檢中，影響所及高達27萬隻鴨鵝。
農委會主委陳保基表示，未來一個月內送檢樣本將持續增加，為即時掌握疫情發展，已與地方達到共識將加促後續撲殺作業；凡確診為H5病毒，並由地方檢疫單位判斷為高致死率，寧可即刻全面撲殺，第一時間管制、消毒。畜衛所所長蔡向榮說明，檢測新移入H5N2及H5N8病毒需待1到3天，若僅檢測H5病毒，可將時程縮短為1日。
農委會13日上午召開的動物疫災緊急應變工作小組第六次會議，行政院副院長張善政也出席坐鎮責成相關防疫單位5項主要目標，包括防止疫情擴散；協助農民因應疫情衝擊，降低損失；確保民眾健康及消費者權益；及時提供正確資訊，避免不必要恐慌；推動各項配套因應措施，避免衝擊環境、民生等。並表示將以「超前部署」的精神處置疫情控制、產銷復原等措施。
張善政並表示，H5N2及H5N8病毒過去雖無人類遭到感染的病例，但考量病毒的高度變異性，仍須提高警戒，請衛福部對養殖業者、周邊居民、防疫人員等密切接觸者持續追蹤，主動採檢，並請各醫療院所提高警覺、主動通報，避免發生防疫漏洞。
防檢局也強調，養禽業者若發現飼養禽類有異常死亡、產蛋率下降等情況，應立即通報地方動物防疫機關，若確診為新型態的病毒，將在撲殺後全額補償，如果是台灣已發生過的病毒，則提供6成補償。相對的，如果超過10%死亡未通報，除將處罰鍰5萬到100萬元，撲殺的家禽也將不會予以補償。