賴秀穗表示，雞隻傳染病目前都有疫苗可預防，一旦雞隻大量死亡，業者應警覺可能是禽流感，為何拖延一個月？有掩蓋疫情之嫌。他懷疑業者很可能是認為飼料出問題、想和飼料業者要求賠償，因此先朝飼料著手。
前家畜衛生試驗所所長劉培柏認為，業者可能自認品管嚴格、以前又沒發生過禽流感，因而誤判；但面對這麼大量、一天高達兩千隻雞隻死亡的狀況，的確該檢討，「防檢局平常也該嚴格監測，不該等到今年才說有監測發現。」
李惠仁：產官集體卸責
曾拍攝《不能戳的秘密》紀錄片、揭發農委會隱瞞禽流感疫情的導演李惠仁則認為，屏東蛋雞場這起事件是「生產者和把關者集體卸責」，生產者不做禽流感檢測、家畜疾病防治所也搞不清楚狀況，造成延遲這麼久才知道有禽流感。
屏縣：上月檢驗 未驗出病毒
屏東縣府表示，十二月中旬透過化製廠監控機制，發現業者場內雞隻死亡數量增加後，立刻前往了解，但當時的血清檢驗結果並未檢出禽流感病毒。
大武山畜牧場指出，接到防檢局的檢驗結果時很錯愕，因之前並未檢出，並非有意隱匿，否則就不會配合政府要求全場撲殺，此次損失約七、八千萬元。
防檢局延遲採樣 稱會改進
對於上月中就有雞隻死亡、本月五日才要求採樣，七日送驗，防檢局長張淑賢表示：「這個我們以後會改進。」不過，她也強調，幾天前該場的雞隻死亡率和產蛋狀況已恢復正常。
根據去年通過的《動物傳染病防治條例》，業者應主動通報異常死亡狀況或疫情，若無通報、結果確認有疫情，不但拿不到補償，還將遭處五萬到一百萬元罰款。