前駐美代表程建人：盼沈妥善處理
李應元與沈呂巡曾在民進黨執政時期同時擔任駐美副代表，此次台美發生互信危機，李應元對這位昔日的外交官同僚形容說，沈的性格較衝動，不像職業外交官，才會徒有愛國心，乃至於進退失據。
當時李與沈兩人的直屬長官、前駐美代表程建人昨談到美方點名沈呂巡離任一事，認為「沒有必要，也不好」，台美非敵對關係，只要沈能妥善處理，兩邊有個共識，按著結論走就好。他還說，台美在經貿、安全及文化等議題有共同利益，重要性遠超過「升旗」，若升旗有顧慮，何不先擺一邊？
程建人回憶任內前總統陳水扁拋出兩岸「一邊一國」，衝擊美中台三邊關係，也經我方與美國充分溝通、達成共識，逐步調整政策，台美互信也逐漸恢復，「我想升旗事件很快就會雲淡風輕」。
對於沈是否撤職？李應元認為，升旗彰顯主權不是錯事，「美國在台協會能升旗，我們應該也要能升旗」，政府應力保沈的職位，不過，技術面上必須改進，避免類似情事發生。他也說，台灣國際處境艱難，外交上朝野立場應一致，爭取國家尊嚴。
昔日駐美處同僚李應元：仍在可修補範圍
李應元認為，駐美代表必須有為有守，掌握分際，沈破壞默契在先，回國後發言也屢掀爭議，但和日中釣魚台、美日琉球軍事基地移轉等紛爭相比，雙橡園升旗爭議較小，仍在可修補範圍。