長榮航空自1993年起，陸續引進10架747-400客貨機，不僅可以載客276人，客艙後方的上貨艙還有溫控設計，可以裝載20到25噸重的貨品，客艙及貨艙間則有特殊的艙門設計，便於工作人員在飛行中進出貨艙，或是保育人員在運送保育動物的航程中，隨時提供動物即時的照顧和安撫。
過去長榮Combi客貨機不僅運送過無尾熊、紅毛猩猩，還有大陸貓熊團團、圓圓及北海道丹頂鶴來到台灣；讓國人驚豔的羅浮宮名畫、畢卡索、莫內、梵谷等大師的作品也都是藉由747-400客貨機飄洋過海來台展出；特別是歷任總統李登輝、陳水扁及現任馬英九總統都曾以長榮Combi擔綱專機出訪中東及中美洲。長榮航空董事長張國煒說：『(原音)這個飛機對長榮來講，我們特別地有感情，因為長榮這20幾年來的發展，今天能發展到全世界公認的好的航空公司，這架飛機幫了長榮非常大的忙。我想在國內來講，包括歷任的總統有幾次都是利用這架飛機到一些比較偏遠的國家，那也肩負了很多特殊動物的引進，包括無尾熊、團團圓圓、丹頂鶴，很多很多的這些知名國外的藝術品也是透過「Combi」這個飛機運送到國內。』
不過，由於747-400機型已經老舊，10架客貨機已經在之前陸續退役，最後這架編號B-16409的波音747-400客貨機也於5日下午3時25分執行完最後一趟飛行任務、從香港返回桃園國際機場後，在桃園機場舉行隆重灑水儀式，光榮退役，也宣告台灣最後一架客貨機從此正式走入歷史。