行政院版中有關眷村改建房地可租或售與因公、作戰傷亡遺眷者相關規定，因民進黨籍立法委員蕭美琴等人質疑做法失當，且有自肥之嫌，最後整條刪除。
國防部報告指出，募兵制為兵役制度轉型重大政策，募兵條例草案內容分就軍人待遇、尊嚴及出路等面向，規劃所需配套措施，包括現役軍人福利、進修、證照培訓及退除役軍人就業補助項目，希望營造青年從軍及長留久任良好環境。
初審通過條文規定，志願役退除役軍人符合支領退休俸、贍養金及生活補助費人員的家屬住宅自用生活所需的水電得予優惠。
有關出路，初審通過條文也明定，志願役軍官、士官預備役人員，依規定志願再服現役或期滿服役者，其期間為3年以下，免受陸海空軍軍官士官服役條例期間最少1年限制；且退伍的女性軍官、士官未志願服預備役者，得視軍事或任務需要，依志願再服現役或其期滿繼續服役。
行政院版條文規定，為提供現役軍人多元進修管道，主管機關得協調大專院校，專案核定在營區內開設學位在職專班。不過，國民黨籍立委林郁方反對，認為軍方應放寬軍人在不影響戰備狀況下，出外到學校就讀、增進和其他學生互動才是良方，而非到營區開課，條文保留協商。
至於中國國民黨籍立委陳鎮湘所提，現行上校以上才可考試轉服公職的規定，應改為考績合格服滿一定年限或作戰、因公傷殘的現役軍人都有參加轉任考試的機會，且分發單位也不限國防部與國軍退除役官兵輔導委員會，應擴至交通部航港局、交通部民用航空局、內政部空中勤務總隊、內政部役政署、消防署等單位。
不過，交通部和考選部對此條文都有疑慮，憂心破壞考試制度，且排擠其他應試人員，條文保留朝野協商。