在全國各機關均停領交通費下，郝市府仍在爭議聲中編列、硬發九億元預算，引來各界批評，柯市長上任立刻喊停，的確符合公平正義，加班費領得合不合理，也該檢視，但關乎市府員工權益之事，卻總在無預警下於媒體發布，等於一竿子打翻一船人，全成了A錢公務員，對屬下不夠尊重，對兢兢業業的人也不公平。
柯文哲上任前曾說，要建立常態性的每週黨團三長溝通平台，平台還沒建立，柯就對外宣布請託案填表、上網，府會聯絡員單一窗口服務等制度。民意代表為選民服務、召開協調會，在部分政策推動上的確造成阻礙，例如窄巷清空政策、違建、違規廣告拆除、非法攤販取締等，甚至各種招標案都有可能為民代介入，但改革要魄力，也要懂得尊重的程序與藝術，才能讓被改革者心服口服。
文化局長倪重華曾在首長遴選會上對柯文哲直言，千萬不能當一個酷吏，要讓市府員工快樂熱情地上班。柯文哲要拴緊市府螺絲，市民絕對支持，但必要的溝通與尊重，才能避免思慮不周帶來的反作用力。（記者陳曉宜）