目前在台中監獄附設培德醫院服刑的前總統陳水扁近日可能獲准保外就醫，台北市長柯文哲30日在市政會議會後記者會上表示，陳水扁確定有病，外界不需懷疑此事，但陳水扁要被保外就醫、特赦還是居家療養，應該是馬英九總統要發揮他的政治智慧。
柯文哲重申，他個人主張陳水扁應居家療養，而且不要再繼續從事政治活動，其他人也不該再利用他。柯文哲說：『(原音)我知道他慢慢會失去行為能力，我也怕別人利用他，就讓他回家好好養病就好了，也不要再出來搞政治了，別人也不要想利用他再做什麼政治上的利用。』
柯文哲表示，陳水扁是個台灣歷史上的不幸，應讓傷害降到最低。
柯文哲上任後第一次舉行市政會議，他在會後記者會一開始就先表達自己對於市政會議的立場。他認為各局處首長應獨立作戰，市政會議只處理有衝突以及需要協調的事情。