受氣候影響，今年下半年水資源缺乏，台灣南、北部將有廣達四萬多公頃農地休耕；經農糧署換算評估，其中有兩萬多公頃是水稻產區，將減產十二萬多公噸一期水稻，約佔整年度還不到一成水稻產量，庫存公糧也相當充裕，不會明顯影響明年米糧供應與價格。
全台各地入秋以來，平均降雨量銳減，颱風也沒有帶來充沛的雨水，使得台灣南、北部地區多個水庫拉緊報，蓄水量嚴重不足，經水利署考量民生與工業用水之後，以宣告南、北兩地將有廣達四萬多公頃農地必須休耕，引起外界質疑會嚴重影響水稻產量，導致米價上漲。
縣長魏明谷表示，彰化濁水溪這條「母親之河」水量充沛，目前農業、民生用水較無急迫性的缺水危機，1期稻作目前不受影響，如果將來面臨限水危機，縣府將確保民生、農業用水無虞。
署長李滄郎表示，雖然公告休耕面積廣達有四萬多公頃，實際上其中只有兩萬多公頃是水稻產區，預估將減產十二萬多公噸，只佔整年度全台可生產一百八十萬公噸水稻、還不到一成的產量，加上庫存公糧相當充裕，並不會明顯影響到整體米糧供應與價格的大幅波動。
不過為了防範以往有少數不肖糧商，趁著稻穀供應青黃不接，或是因天災、大面積休耕之際，趁機蓄意哄抬米價，李滄郎署長表示，農糧署已組成應變小組，將密切注意市售米糧的供需的情況，必要時將會適時釋出龐大的公糧，維持讓農民利潤、消費者也能接受的平穩米價。