柯文哲上午9時在台北市政府宣誓就職，與前任台北市長郝龍斌舉行交接典禮，正式就任台北市長。隨後柯文哲陪郝龍斌走到市府大門口，沿途市府員工夾道歡送郝龍斌、歡迎柯文哲。
市府大門外則有數個民間團體前來陳情，人民民主陣線、基層護理工會一大早就到北市府門口，質疑21日開幕的「台北國際醫旅」圖利財團，要求柯文哲調查；日日春協會要求應把文萌樓收歸公有；還有西服公會、護樹團體等前來陳情。
十二年國教家長聯盟、國教行動聯盟則質疑，新任教育局長湯志民私下積極運作，要變動明年免試入學方案，家長團體大喊「柯P！你被騙了」、「拒絕黑箱」等口號。
柯文哲走到門口時，家長代表陳綺貞衝上前遞陳情書，並堅持由柯文哲親自收下；僵持一陣子之後，柯文哲雖臉色不太好看，仍伸手接下陳情書，交給身旁幕僚。
柯文哲受訪時說，他上班就開始解決問題，每天都有抗議，把問題解決就是他來的目的。他希望抗議要有正常管道，不要用這種方式處理。
由於現場混亂，柯文哲僅短暫受訪1分多鐘就離去。
稍後柯文哲前往市長辦公室批閱第一份公文，是局處首長的人事案；他還指示市長辦公室主任蔡壁如，要撤掉辦公室內的花，市長的椅子也要換掉，連會議桌的椅子「要不要都換成390元的塑膠椅就好？」
批閱公文後，柯文哲參加副市長跟一級首長宣誓就職與交接典禮，完成交接後的致詞，柯文哲僅簡單宣布一句話，「那就上工吧」。