食品藥物管理署日前公告，包裝食品若含基因改造食品原料，應標示「基因改造」或「含基因改造」字樣，並在2016年開始實施。引發民進黨立委田秋堇大為不滿，24日在立法院社福衛環委員會質詢時批評，今年2月總統府就已公告修正通過的食安法，要求基改食品的標示，且立法院通過的附帶決議也要求基改食品原料應比照歐盟標準，也就是含量超過0.9%就應標示基改字樣，但食藥署日前竟公告的超過3%才需標示，且將正式實施時程往後延宕，質疑食藥署替業者護航。田秋堇說：『(原音)明年1月來不及，至少明年4月可以吧！至少明年6月，哪裡需要這麼久？你就只會站在業者立場著想，你拖到後年我們大家都卸任了。』
對此，衛福部長蔣丙煌允諾，將研商將基改食品的標示提前至明年6月實施。蔣丙煌說：『(原音)我回去以後跟食藥署研議看看，我盡量要求他們往前提，明年6月我來朝這個方向，除非有真正的困難不然就是這個方向。』
田秋堇強調，若衛福部沒有如期讓基改食品標示在明年6月前上路，屆時將公布衛福部裡有基改食品業者的門神。