特偵組偵辦前行政院秘書長林益世涉貪案期間，邱毅、林瑞圖多次在政論節目指控陳武進是「南部圍標集團首腦、操控公共工程招標」，並介入高雄市政府環保局對地勇公司斷料，遭陳武進自訴控告兩人妨害名譽。
高雄地方法院審理時，邱毅和林瑞圖都否認涉及誹謗犯行，並要求法院調閱林益世案偵查資料，以證明不是無的放矢。雄院審結，認定兩人毀損陳武進名譽，依誹謗罪分別判處邱毅1年、林瑞圖10個月，均得易科罰金。
邱毅、林瑞圖不服一審判決上訴，台灣高等法院高雄分院審結，依誹謗罪分別判處邱毅6個月及林瑞圖5個月，均得易科罰金，全案確定。