準台北市長柯文哲與宜蘭縣長林聰賢日前會面達成共識，準備將現行北宜直鐵規劃案從繞過翡翠水庫改成穿越翡翠水庫，以節省通車時間，引發社會爭議。
交通部長葉匡時11日受訪時指出，不少人質疑，北宜直鐵目前繞過翡翠水庫的方案，只為了節省18分鐘，卻要花費新台幣500多億元，並不值得。問題是現在北宜鐵路的運能已經到頂，即使添購新車、加開班次，增加的運量也有限。因此，未來如果宜蘭及花東地區的旅客量持續攀升，台鐵運能將無法負荷。
葉匡時表示，提升運量的另一個方法是鋪設雙軌，就像許多西方國家的鐵道甚至到4軌。不過由於北宜鐵路蜿蜒曲折，要擴充成雙軌並不容易，因此交通部才有興建北宜直鐵的想法。所以重點不在節省多少時間，而在運量必須增加。葉匡時說：『(原音)可是北宜鐵路呢，當初蓋的時候就是比較曲折，沿著山哪或海啊，路廊不是很理想，所以如果你在目前的北宜鐵路旁邊，再加2個軌呢，大概也有困難。所以我們台鐵局的很多同仁、專家就認為，確實有需要來增加這一條北宜直鐵，重點不是減少多少時間，重點是我們的運量可能已經到上限，必須增加運量。』
目前北宜直鐵規畫經過大溪－頭城的第2方案，已經行政院核定，並已發包進行環評和綜合規劃，預計明年3、4月即可完成。不過新任市長如果有異見，一切又得重頭來過，想節省通車時間，但興建的時程卻更加遙遙無期。