九合一選舉執政黨大敗，行政院1日上午10時召開臨時院會，提出內閣81位政務官總辭案，通過總辭後就進入「看守內閣」階段，不做重大政策決定。
國民黨的敗選，雖然兩岸金融在時程上如期往來，但是能夠討論的議題，變得相當有限。
金管會表示，目前金融三會（金銀、金證與金保會）時程，大約就是訂在24日到27日之間，不過由於服務貿易協議還卡在立法院，因此兩岸金融涉及市場准入以及政策性的開放，恐怕推動上會有難度，簡而言之，金融三會甚至連爭取人民幣境內資格機構投資者（RQFII）的額度，都會有困難。
金管會主委曾銘宗認為，金融三會是已經建立的制度不應該中斷，金管會將盡量爭取非政策、非市場准入的開放。
政治大學金融系教授殷乃平表示，此次選舉的結果雖然顯示台灣民眾對於國民黨的兩岸政策有疑惑，但是北京方面也是觀望的態度，並且會持續觀察至服務貿易協議過關或者2016年（總統選舉）台灣的態度。
但兩岸金融因此卡關？殷乃平並不悲觀，兩岸金融往來原先就建立在備忘錄(MOU)上，由於去年兩岸金融三會所談的內容寫入服貿，才使得開放因此而停擺，他建議，可以回歸MOU上，思考如何求得突破。
淡江大學財金學系教授林蒼祥表示，由於選舉的結果，不只讓服貿協議繼續卡關，而且中國大陸也將不再急著與台灣洽談開放，因此台灣金融業想要短期在大陸更大的發展，恐有困難。
林蒼祥認為，不過金融業不用過於擔心，可以考慮東協、東南亞市場，由於近期東南亞經濟成長快速、台商也積極到東協國家投資，例如印尼、印度等國家，主管機關可以考量協助金融業。
林蒼祥說，東協國家的銀行業規模不大，中小型銀行有機會競爭，而不只限大型銀行，就不會有「資源分配不均」的問題。
金融圈與其憂心兩岸金融大倒退，被困於台灣之內，不如轉個方向吧。