報導分析，這次選舉將更削弱總統馬英九及國民黨的支持度，也將使民進黨更難處理與大陸之間的關係，同時大陸也將權衡選擇如何推進終極統一的目標。
從選舉結果顯示，選民關切低薪及收入不平等切身議題，分析師認為，此舉勢必使得兩岸經貿緊密融合的關係，縱使不停止，也將趨緩。
報導引述台大政治系主任王業立指出，「馬總統剩下任期將成為跛鴨總統。一些中國有關政策遇到的阻力勢必更大」。有一種因素正在轉變中，台灣的年輕人擔心與大陸過於接近，淘空台灣的經濟與社會。
立法委員陳學聖說，「我們看到年輕人開始對大陸存疑，他們用選票表達對政策的不同意，包括政府處理兩岸事務的方法」。
北京聯合大學台灣研究院副教授李振廣認為，「選舉結果將預知兩岸關係將進入寒冷期（chilly period），而在可預見的未來，縱使兩岸協商仍將繼續，也很難再簽署任何經貿協議」。
華爾街日報同時認為，民進黨贏得選舉也要思考如何大陸交往。儘管雙方在?下已有交流，但大陸對支持獨立的民進黨始終小心翼翼。
報導引述民進黨秘書長吳釗燮表示，民進黨與北京雖有交流，但大都是非正式的。民進黨對與大陸的進一步交往抱持開放態度，惟北京總設有前提。
報導同時引述台灣智庫研究員董立文分析，大陸對民進黨將雙管齊下，一方面認可及背書兩岸官方、學界的交往與接觸，但又會不斷施壓盼民進黨讓步，諸如要求民進黨停止台獨黨綱。