柯營幕僚表示，柯文哲曾承諾，將捐出選舉補助剩餘款，也會將其中一部分捐給台大醫院，作為年輕醫師研究經費，柯也絕對不會成立基金會，但細節仍待討論。
連營：確定發放再公布
連營發言人錢震宇表示，等中選會確定發放這筆款項之後，會再對外公布相關用途。
台北市選委會副總幹事黃細明表示，依選罷法規定，只要候選人得票數達到當選人票數的三分之一以上，每票可獲補助款卅元，補貼競選費用。
柯文哲得八十五萬三千九百八十三票，換算可得兩千五百六十一萬多元，連勝文獲六十萬九千九百卅二票，補助款共一千八百餘萬元。
其他五位市長候選人得票數未達門檻，無法領到補助款，也因得票數未達總選舉人數的十％，兩百萬元參選保證金也將沒收進入市庫。