BBC中文網今晚刊登林祖嘉的專訪內容，在訪談中，談到中國大陸希望兩岸能就政治分歧協商，林祖嘉表示，「台灣人對兩岸議題都很敏感，現在應該還不是時間，現在兩岸間要做任何的政治議題，還不是時候。」
BBC說，尤其是今年3月的太陽花學運，讓台灣一些人士擔心，兩岸過於緊密的經貿關係，會讓台灣過度依賴大陸，打擊台灣的自主性。林祖嘉深知今日台灣與大陸經貿往來背後的政治敏感。
但林祖嘉強調，「對我們來說，（兩岸談政治議題）時機真的還不太成熟。」他又補充：「經濟議題歸經濟，政治議題歸政治。」
不過，BBC中文網指出，太陽花學運卻讓兩岸議題蒙上陰影。行政院版的「兩岸協議監督條例」已經交付立法院，但仍未獲得審議通過。
林祖嘉強調，兩岸現在的談判以經濟為主，兩岸的交流也不會因為一些人士的阻撓而停止。
他說，兩岸的經貿協商還將繼續持續下去，陸委會也希望在海峽交流基金會的架構下，雙方明年互設辦事機構。
林祖嘉表示，雙邊來往這麼多，都需要在地的協助。如果雙方互設辦事處，可以提供在地的即時服務。
BBC指，台灣正在研究如何透過加入跨太平洋夥伴協定（TPP）和區域全面經濟夥伴協定（RCEP）提升台灣的競爭力。
對此，林祖嘉強調，「開放才是唯一的路。」尤其台灣有足夠的人才，又是多元化的社會，台灣人在創新方面沒有問題，面對競爭也沒有問題。