全世界蘭科植物目前約有2萬5千多種，其中，蝴蝶蘭是最受歡迎的盆栽園藝作物。台灣蝴蝶蘭提供全世界最重要的蘭花供應鏈，是台灣主要的外銷花卉之一，年產值高達新台幣80億。
成功大學生命科學系特聘教授陳虹樺指出，之所以選擇小蘭嶼蝴蝶蘭作為基因解碼標的，是因為在所有蝴蝶蘭品種中，超過三分之一都是小蘭嶼蝴蝶蘭的後代，它同時也是台灣原生種之一，相當有代表性。
陳虹樺表示，小蘭嶼蝴蝶蘭全基因解碼後，轉譯出多達2萬9,431個基因，進一步分析後，發現蘭花具有較多的MADS-box基因群組，是控制蘭花與其他植物的花辦與花蕊形態不同的主要原因。陳虹樺說，有了小蘭嶼蝴蝶蘭的全基因體解序，未來就能育種出不同的蘭花花形與香氣，對台灣蘭花育種技術是一大突破。陳虹樺說：『(原音)解序完之後，對整個蝴蝶蘭的育種有更進一步的幫助，就像人類基因體解碼，我們就開發新藥，治療疾病那一塊就可以很快推進。那這邊小蘭嶼蝴蝶蘭基因解碼，我們希望達到一個狀態，就是我們可以更快速作分子育種、分子選拔育種，我們希望它甚麼樣子的樣式，我們就可以從基因這邊下手。』
除了藉由基因解碼提高蘭花的觀賞價值，陳虹樺強調，蘭花也具有藥用功能，他們的基因解序結果未來也可應用在藥物與保養品開發，商機無窮。