對於表現不佳的地方政府，行政院發言人孫立群說，將研擬減少該地方政府計劃型的補助，以有效激勵地方政府積極打擊不法並解決食安問題，具體落實作法已責成衛福部研訂辦理。
孫立群說，未來中央政府也會每年考評地方政府的食安工作，並公布各地方政府的成績與名次，以激勵地方政府積極查緝黑心業者。
江宜樺日前在立法院總質詢時表示，要將查緝食安工作做為地方政府的施政績效，並納入中央政府補助地方政府的特別統籌分配稅款經費參考。
孫立群上午表示，根據財政收支劃分法規定，特別統籌分配稅款是用來支應地方政府緊急及其他重大事項所需經費，歷年來主要用於協助地方政府災害搶修及復建所需經費，及因應中央急需或重大政策推動，協助支應各地方政府均須配合辦理的項目，例如「希望就業專案」及「招商獎勵金」等，這些專案的申請與審查程序，都由各該政策主管機關訂定。
孫立群說，查緝食安問題必須中央與地方一起努力，才有可能奏效。中央負責政策方向的統籌與制訂，地方負責第一線的查緝作業。
他表示，為了激勵地方政府積極打擊不法，江宜樺拍板決定每年提撥10億元統籌分配稅款做為績效獎金，以展現政府處理食安問題的決心，同時希望避免再次出現民眾投訴、地方政府不處理的情況。