中韓自由貿易協定（FTA）宣布完成實質談判，政府及部分產業界憂慮未來影響難以估計，但也有產學界人士認為，FTA絕非萬靈丹。
杜紫軍強調，不是台灣爭取比中韓FTA更好的條件，未來台灣的產業就會發展得比韓國好，最後的決勝點還是企業的競爭力，爭取簽FTA是在力求市場的公平性，不要讓業者因為市場的不公平，抵銷好不容易努力得來的競爭力。
他以2007年6月韓東協FTA完成簽署後，東協自台韓兩國的進口額變化舉例指出，2007兩國進口額只差一點點，分別是台灣201億4100萬美元、韓國為194億8300萬美元，但到了2010年韓東協FTA完成階段性降稅，台韓的距離整個拉開，台落後韓國346億5900萬美元。
杜紫軍說，我國這兩年不斷努力深耕東協市場，但韓國還是成長比我們快，2013年韓國仍以159億5300萬美元的距離，贏過台灣，「這就是FTA帶來的好處」。
同樣的，他以台星經濟夥伴協定及台紐經濟合作協定分析，統計5至10月台灣對新加坡出口成長7.6%；去年12月至今年9月，台灣對紐西蘭出口成長15%；而對比ECFA早收清單539項與其他未降關稅的產品，也有同樣的情形。
杜紫軍強調，中韓FTA不管是立即、5年、10年降稅或20年降稅，對台灣來說都是威脅。如果拿不到一樣好的競爭條件，沒有辦法維持競爭公平性，「那麼遲早對台灣都不是一件好事」。