信用卡付費仍享95折
台鐵指出，今起週一至週四期間，太魯閣、普悠瑪與柴聯自強號票價差拉大，以台北—台東為例，現場購買普悠瑪號來回票為一五六六元，柴聯自強號是一三六七元，相差一九九元；但若是使用信用卡可享九五折，台北—台東普悠瑪號的信用卡網路購票價為一四八八元，柴聯自強號為一二九九元，相差一八九元。
旅客批變貴又變慢
目前普悠瑪號台北—台東依停靠站數不同，行車時間約在三小時卅分到三小時五十五分之間；柴聯自強號則為五小時四十七分到五小時五十分。十一月十八日改點後，部分半直達普悠瑪號會多停靠六站，柴聯自強號則改為半直達，行程差距約在半小時內。
旅客批評台鐵取消折扣等於變相調漲，想要客群分流，一部分普悠瑪改為多站停模式，卻讓北東車程多出二十幾分鐘。從台北嫁到花蓮的王小姐表示：「台鐵怎麼不想如何全面提升運能，還讓部分普悠瑪變貴、變慢，百年老店到底在想什麼？」
已購票者優惠不變
台鐵回應，新自強號取消九折優惠，但是以信用卡付費仍有九五折優惠，十一月九日前已訂購來回票或網路付款者，換票時優惠不變。另外，四一二次及四二五次普悠瑪號是為了回應地方的需求，才改多站停模式，北花時間不變，花東之間增加廿到卅分鐘，其他原有普悠瑪號行車時間不受影響。