吳清基在民國90年參選台南縣長，以小幅差距敗給前台南縣長蘇煥智；選後捐出選舉補助金，再加上自己及民眾的捐款共新台幣1000萬元，以母親的名字成立「吳林盡教育基金會」。12年來以基金孳息、及向社會募款，每年在故鄉台南發放清寒子弟獎學金，今年共有100名學生獲獎。
吳清基表示，獎學金的金額雖不高，但對獲獎的孩子和家長來說，是一種為未來努力的動力和默契。
他說，自己在初一升初二的那年，拿到人生第一份獎學金50元，這筆錢相當於是母親在外打工1個星期的工資。當年把獎學金交給母親時，母親感動流下眼淚，似乎看到兒子靠讀書出人頭地的希望，之後更努力工作；他自己也一路靠著苦讀、拿獎學金，一路唸到博士，還當到教育部長。
吳清基說，希望大家不要埋怨社會、埋怨家庭環境，靠著努力向上的信念用心去做，一定會有希望。
吳清基指出，當年代表國民黨參選台南縣長，選後國民黨沒有收回選舉補助金，也支持他回饋鄉里的做法；民進黨在選舉時隨便騙一騙，後來什麼也沒做，兩相比較之下，大家可以很清楚看到差別在哪裏。
他說，自己小時候拿到獎學金後，就立志有朝一日要設立獎學金來回饋社會；希望今天獲獎的學生們未來也能有回饋社會的心，讓溫暖一直傳下去。1031109