台南市政府延遲下架北海油品，遭到許多批評，賴清德接受媒體訪問時指出，問題食品是否預防性下架，制度尚未建立，實務上都是衛生福利部和地方衛生單位依實際狀況處理。
他表示，理論上，應是檢察官將案件偵查終結，在起訴犯罪業者的同時，也公布涉及使用劣油的廠商名單，讓中央和地方衛生單位據以執行下架動作。
他說，若是基於公益及防止劣油繼續危害民眾健康的考量，檢方在案件偵結起訴前，也可在適當時機舉行記者會，說明案情及公布相關廠商名單，由衛生單位決定是否採取預防性下架，但南檢在北海案沒有這麼做。
賴清德說，台南市政府和台南地檢署都是政府一體，本來就有食安聯合稽查平台，台南市衛生局若有任何失職之處，檢方都可直接和市府對話、說明，讓市府據以檢討、改進，若有失職者，該懲處就懲處。
賴清德表示，台南市衛生局哪裡做得不好、不對、違法，檢方大可具體提出，直接通知，公開揭露，不必隱諱，但市府迄今都未收到檢方正式、口頭或書面公文的知會，有關檢方的說法及批評，全來自媒體匿名引述，這種爆料式的報導，市府要去哪裡查證？