吉園圃安全蔬果標章誕生有其歷史背景，主因為讓農藥用量較大的過去，用藥能更合理化；但近幾年來屢傳濫用，近期又被舉證屬實；標章及相關農藥品質控管等諸多機制，再次被檢討，並確定要停用。
農委會預計民國108年6月15日停用，但為免已經使用此標章的2127個產銷班農民恐慌，規劃104年7月先停止第一次申請使用標章產銷班的申請，106年1月則停止續約使用的申請，108年6月15日才完全停用。
標章的推動始於民國82年，每次申請通過可使用3年。
陳保基重申，吉園圃安全蔬果標章已實施21年，是為了鼓勵農民合理用藥，努力達到政府規範的農藥殘留標準後，所發予的一個標章。
他並說，吉園圃安全蔬果標章有階段性任務，但農藥殘留標準並沒有因此退場，國家標準的最低農藥殘留檢驗標準，仍然保持著。
因應國際間都已推動生產履歷、有機標章及QR CODE追溯系統等機制多年。陳保基進一步說，農委會規劃輔導農民轉型推動國際市場執行有年的QR CODE追溯系統，讓生產者更能夠負起責任。
他比喻說，若農藥殘留的國家標準是考試及格的60分，追溯系統約是70分，可讓農民更能負起安全用藥等生產責任。
農委會推動吉園圃安全蔬果標章停用，並非首次。農委會農糧署副署長黃美華舉例，82年推行的吉園圃，於95年時，因應統一所有標章的檢討，曾將CAS與吉園圃結合過。
到96年1月16日，公布施行農產品生產及驗證管理法，曾要輔導所有使用此標章產銷班轉做生產履歷，並決定同年6月暫停標章的使用申請審查，但馬上有農民反彈，7月又恢復使用。98年又與CAS分開，再度成為單獨的吉園圃安全蔬果標章。