被打造為東方諾貝爾獎的唐獎，首屆活動於9月落幕。「永續發展獎」得主為布倫特蘭夫人（Gro HarlemBrundtland）；「生技醫藥獎」為本庶佑、詹姆斯‧艾利森（James P. Allison）；「漢學獎」為余英時；「法治獎」則是奧比‧薩克思（Albert Louis (Albie) Sachs）。
翁啟惠接受中央社專訪表示，舉辦國際獎項是一個挑戰，中研院擔任評選得獎者的重責，各界也都在看，是不是有能力辦好。首屆唐獎選出的5位得主，他都非常滿意，事前也不擔心，因為只要選出好的評選委員，就能挑出好的得主。
翁啟惠表示，中研院院士素質相當好，成員不侷限於台灣，也包括海內外華裔和外籍人士，高達2/3以上的中研院士在海外工作，其中有超過80位是美國國家科學院相關院士，絕對有資格擔任國際獎項的評委。
翁啟惠認為，唐獎不只是一個獎項，透過肯定得獎人的貢獻，同樣也告訴國際社會，台灣重視這些領域，藉此影響世界的研究方向。
除此之外，唐獎得主來到台灣的「唐獎週」活動，除了頒獎典禮，還有故宮特展、音樂會、主題餐會，讓國際更瞭解台灣的特色，「唐獎的主角是台灣。」
翁啟惠並表示，唐獎首屆評選必須打開一定格局、建立國際知名度，雖然不明說，評選委員心裡都知道，首屆不能選出來都是華人。如果都是華人得獎，就算評選再公正，國際上也一定會遭人閒話。
翁啟惠表示，評選過程完全授權各獎項委員會，選出最好的人選，中研院院方、唐獎基金會都沒有意見。事實證明，在這樣的機制運作下，首屆選出來的人都備受國際肯定。例如生醫獎得主開發的藥物，今年7月通過日本核准，今年9月美國核准，唐獎卻是領先一步在6月就選出來，「可見評委的眼光非常好。」
不過翁啟惠也透露，在選出得獎者後，他們確實有擔心過一些政治問題，例如永續獎得主布倫特蘭夫人曾是挪威總理，不一定能來台灣。唐獎頒獎之後，漢學獎得主余英時的著作，也於近日傳出遭中國大陸封殺。
另外，外界也擔心唐獎由中華民國總統頒發，未來如果得主是中國大陸籍，可能會受到政治因素干擾。
對此，翁啟惠說，頒獎就該頒給最好的人，不能考慮政治因素。評委必須非常超然，從原創性、對人類社會的具體貢獻著眼，如果有人從政治角度批評，「應該去問批評的人，怎麼會這樣看。」
提到對首屆唐獎得主的印象，翁啟惠提到，布倫特蘭夫人到各個場合，總是告訴主辦單位，冷氣不要開太冷、燈光不要打太亮，真正把環保觀念落實在現實生活之中。
布倫特蘭夫人也曾批評晚宴中總統還在講話，底下卻鬧哄哄，以及沒吃幾分鐘就不斷有人敬酒，看在翁啟惠眼裡，他覺得布倫特蘭夫人既挑剔，又很直率。