針對近來劣質豬油事件，馬總統13日晚間召集召集府、院、國安會等相關單位，舉行國安高層會議。在聽取簡報後總統指示，將把現行行政院食品安全推動工作小組，擴大成「食品安全辦公室」，總統府發言人馬瑋國：『(原音)馬總統指示，為提高食安層級，政府將比照災害防救組織模式，將現有行政院食品安全推動工作小組，擴大成「食品安全辦公室」，以推動跨部會的食品安全管理工作。』
馬總統強調，政府一定要讓社會大眾感覺到執行公權力的魄力和決心，要把黑心業者徹底清除、讓民眾生活恢復正常，不查乾淨絕不停止。而針對頂新、正義、強冠等黑心廠商之作為，馬總統予以強烈譴責；並呼籲民眾和政府聯手，對於黑心產品及企業的黑心行為，予以查辦、抵制到底。總統也呼籲在野黨與執政黨攜手，早日完成食品安全衛生管理法修法的立法程序。
馬瑋國轉述，總統於會中表示，食品安全事件造成民眾以及廠商損失，今日國安高層會議目的就是擴大政府單位參與，但是黑心廠商讓民眾對食品安全失去信心，並嚴重影響台灣聲譽和對外貿易，對於黑心廠商一定要查辦到底、絕不寬貸。
總統也指示，除了確保源頭管制、物流行銷、及廢油回收各階段的嚴查重罰，也要照顧到民生，確保豬油市場供應無虞。對此，食品藥品安全會報召集人，行政院副院長毛治國指出，國內豬油需求占全部食用油不到10%，主要用於烘焙業及食品加工之用，在未來豬油可能短缺期間，相關業者除採取自行榨油、或改採用植物油作為替代之外，政府也會採取將豬油進口關稅減半、緊急進口小包裝豬油、鼓勵合法業者增產等措施，以確保民眾及相關業者用油無虞。