〔自由時報記者楊菁菁、黃立翔、劉禹慶／綜合報導〕「海研五號」船務代理公司昨天表示，船長黃余發當時回報，船體碰撞不明物體發出兩聲巨響，接著機艙進水、失去動力，海研五號從船尾沉入海裡；多名獲救人員則說事發前聽到爆炸聲，這兩聲巨響是什麼？尚待調查，不過，多名海事專家及資深船長研判，海研五號船齡才兩年，設備又先進，會發生船難「很不可思議」，與人為因素脫離不了關係。
月內釐清責任 船長10萬交保
交通部航港局表示，昨已啟動海事調查，已蒐集海研五號上即時傳回的航海數據資料，必要時派潛水員下海撈取船舶黑盒子（ＶＤＲ），ＶＤＲ記錄航行參數、機艙參數、安全參數，甚至包括駕駛台通話和其他通信、雷達等資料，預計兩週內完成初步調查報告後，再花兩週完成完整評議報告，釐清責任歸屬。澎湖地檢署昨日約談船長黃余發，訊後以十萬元交保，並限制出境。
兩聲巨響 船進水、失去動力
負責海研五號船務代理及船員管理的裕品實業，船長及船員都由該公司負責管理，該公司副總經理陳明泰就是海研五號第一任船長。他說，黃余發船長當時回報，船體碰上不明物體發出兩聲巨響，接著發現機艙進水、失去動力，這就像是汽車引擎泡到水熄火一般，無法再發動。
船長建議不要出海 被打回票
他表示，海研五號最大耐受程度為八、九級風浪，但前天中午過後出現十級風浪，船長評估風險，決定返航；陳明泰強調，這是正確的決定。黃余發昨天則說，前天出海前，因風浪過大，他曾建議不要出海，但被打回票。
獲救者說，前天晚餐後，船長廣播尾艙進水，要大家棄船逃生，接著船身就開始向右傾斜，隨即發生船難。
目前船難原因仍在調查中，但包括多名海事專家都認為，以「海」船僅兩年船齡、船上又有最新的聲納設備可躲避礁石，會發生意外「很不可思議」；多名澎湖資深船長則認為，船難與人為因素脫離不了關係。
設備可避礁石 意外不可思議
澎湖磯釣協會理事長呂正林表示，當地海流湍急、暗礁多，雖然有海圖與衛星監測儀器輔助，但每隔一段時間暗礁會遭破壞，或被流沙掩蓋，導致資訊不正確，加上東北季風與大潮肆虐下，大船很容易偏離航道，在九級風情況下，會造成誤差二浬，約有五公里距離，因此偏離航道可能性很大。
另外，常載客前往查某嶼、查坡嶼海域磯釣的船長賴一志則表示，海研五號設備新穎，又是鐵殼船體，吃水只需要五米，當地水深約二十幾米，若非受到觸礁重創，不太可能會發生沉船意外，懷疑可能是離岸過近，或者是先前已觸礁進水，未立即處理，才會被海流帶動漂流，船艙進水後導致失去動力；部分澎湖海巡隊隊員也抱持相同看法。澎湖海巡隊資料也顯示，海研五號觸礁通報與沉沒地點相隔約二浬。
航港局長祁文中說，調查人員昨已前往澎湖了解，並將逐一訪談包括船長、輪機長、大副當值駕駛（輪機）人員及代操公司管理人，確認「到底當時發生甚麼事」，並由航港局台北任務管制中心調閱船舶定位系統資料。