邱文達因劣質豬油事件辭去衛福部部長職務，新任部長何時出爐備受各界關注。包括國民黨立委、醫師公會全聯會理事長蘇清泉、台北市立聯合醫院總院長邱文祥、台北榮總院長林芳郁、國健署署長邱淑媞等人都被點名是可能接任的人選。
不過，林芳郁9日在立法院外交國防委員會答復民進黨立委陳歐珀質詢時，否認自己曾被徵詢，並表示他沒有接任衛福部長的規劃。林芳郁說：『(原音)(立委：有沒有跟你徵詢？)不可能啦！一方面沒有徵詢，一方面我也沒有那個規劃。』
陳歐珀則指出，林芳郁過去擔任衛生署長時，將三聚氰胺檢出標準從0ppm改為2.5ppm，雖符合國際標準，卻因朝令夕改引發民怨，林芳郁因此請辭下台是高度負責的表現。他期許林芳郁能實現過去「只要是對的，就勇於去做」的承諾，未來若有機會，應接下衛福部長，但林芳郁回說「接任衛福部長是錯的」。
行政院長江宜樺日前在立法院答詢時曾表示，新任衛福部長將「用人唯才」，不管是來自醫界、公衛界或社福界都有可能，最慢不超過1個月、快則1週就能確定人選。