環保署長魏國彥上任後爭議不斷，先是出國考察天數太多引發質疑，現在又遭「周刊王」爆料，指魏國彥縱容親信秘書張晨恩批改公文，讓同仁有苦難言。
魏國彥30日在立法院接受民進黨立委蔡其昌質詢時澄清，他僅是請機要人員幫忙針對簽到署長辦公室的公文進行核稿，挑出錯別字與不當用詞，以提升公文的品質，每件公文他都自己看並自己核章，「密」件公文也由自己處理。魏國彥說：『(原音)簽到署長辦公室幫忙核稿，最後是否核稿正確由我決定，基本原因是加強公文品質。(保密的公文怎麼辦？你的機要有沒有看？)密的公文我自己拆。』
不過，蔡其昌仍質疑魏國彥請機要人員幫忙核稿過於荒謬、懶惰，魏國彥則強調，決策端仍由他負責，並無放任由機要人員處理。他說：『(原音)我要核章，若有所建議，我要核章，並不是放任、不可能的，最後負責還是我在負責。』
蔡其昌並詢問行政院長江宜樺是否贊同魏國彥讓機要核稿？江宜樺則表示，若是公文本身決行與否，當然須由署長或相關主管決定；至於公文的陳述及格式等品質方面，通常有負責核稿的同仁；至於機要人員能否核稿，或是進行文字方面的檢視，則由首長自行參酌。