澎湖南方四島國家公園位於澎湖南方海域望安嶼及七美嶼以東，包括東吉嶼、西吉嶼、東嶼坪嶼、西嶼坪嶼及周邊島礁，陸域面積約370公頃，海域面積3萬5473公頃。
澎湖南方四島國家公園具有玄武岩地質、生物多樣性海洋生態資源及島嶼人文地景等資源特色；內政部說，將運用南方四島的特殊地質、海洋及人文資源，以發展海洋環境教育為願景，讓民眾瞭解台灣的海洋特色。
澎湖南方四島國家公園是行政院民國95年12月19日核定東沙環礁國家公園計畫時，指示由內政部營建署海洋國家公園管理處統籌評估規劃。
經過多年規劃，行政院於今年3月10日核定，並於6月8日國際海洋日正式公告實施，10月18日正式掛牌運作。