台灣大學教授、前食品藥物管理局長康照洲任內歷經塑化劑、毒澱粉風暴，他今天在台灣大學食安論壇中指出，「殺豬和做豬血糕，只有一牆之隔，卻由農政和衛生分頭管，這很奇怪」。
中研院副院長陳建仁指出，衛福部一肩扛起食安權責太沈重；台大公衛學院院長陳為堅指出，政府各部沒有穩定高頻率的橫向聯繫組織，法規沒有落實。
目前，農委會掌管農產品管理，經濟部掌管食品工廠，環保署掌管化學品。參加多次行政院食安會報的陳建仁認為，政府應思考「生產端到上市風險管理」，建立產製認證規範系統到多層次監測、通報網絡的產業鏈管理。
康照洲表示，不僅食安和農業應做適度整合，政府的管理單位太多、太雜，食安問題牽涉廣泛，應該仿照日本成立「食品安全委員會」，讓風險評估、管理、稽查互相監督，以便有效解決問題。
外界將食安稽查漏掉歸責於人力不足、欠缺公權力，義美總經理高志明卻有別的見解。
高志明說，稽核人員是約聘顧人員，經驗素質不夠，只做3個月就離職，也沒有簽保密協定，「沒有專業證照憑什麼稽查？憑什麼要廠商攤開配方資料、商業機密」，義美找外商稽核時要外商籲保密協定，政府的稽核人員應該立法嚴格管控，簽保密協定，才能確實有效稽核。
高志明也提到，食品技師證照的制度很好，但現在的食安技術卻是有學歷、證照，進了食品工廠卻什麼都不會，建議政府應該限制考照人從學校畢業後，應有相關產業經驗2、3年，才能考食品技師。